以下记录是我自己常用的 以及网络上一些优秀的win2003服务器安全设置方案
首先配置各个磁盘权限 win2003采用 ntfs格式 方便的让用户设置各种权限 权限设置好了 即使黑客拿到webshell 也没法对你的服务器采取行动
C盘只给administrators 和system权限，其他的权限不给，其他的盘也可以这样设置，这里给的system权限也不一定需要给，只是由于某些第三方应用程序是以服务形式启动的，需要加上这个用户，否则造成启动不了。
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Windows目录要加上给users的默认权限，否则ASP和ASPX等应用程序就无法运行。以前有朋友单独设置Instsrv和temp等目录权限，其实没有这个必要的。
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另外在c:/Documents and Settings/这里相当重要，后面的目录里的权限根本不会继承从前的设置，如果仅仅只是设置了C盘给administrators权限，而在All Users/Application Data目录下会 出现everyone用户有完全控制权限，这样入侵这可以跳转到这个目录，写入脚本或只文件，再结合其他漏洞来提升权限；譬如利用serv-u的本地溢出提升权限，或系统遗漏有补丁，数据库的弱点，甚至社会工程学等等N多方法，从前不是有牛人发飑说：”只要给我一个webshell，我就能拿到system”，这也的确是有可能的。在用做web/ftp服务器的系统里，建议是将这些目录都设置的锁死。其他每个盘的目录都按照这样设置，没个盘都只给adinistrators权限。
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另外，还将：net.exe，cmd.exe，tftp.exe，netstat.exe，regedit.exe，at.exe，attrib.exe，cacls.exe，这些文件都设置只允许administrators访问。
把不必要的服务都禁止掉，尽管这些不一定能被攻击者利用得上，但是按照安全规则和标准上来说，多余的东西就没必要开启，减少一份隐患。
在”网络连接”里，把不需要的协议和服务都删掉，这里只安装了基本的Internet协议（TCP/IP），由于要控制带宽流量服务，额外安装了Qos数据包计划程序。在高级tcp/ip设置里–“NetBIOS”设置”禁用tcp/IP上的NetBIOS（S）”。在高级选项里，使用”Internet连接防火墙”，这是windows 2003 自带的防火墙，在2000系统里没有的功能，虽然没什么功能，但可以屏蔽端口，这样已经基本达到了一个IPSec的功能。
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这里我们按照所需要的服务开放响应的端口。在2003系统里，不推荐用TCP/IP筛选里的端口过滤功能，譬如在使用FTP服务器的时候，如果仅仅只开放21端口，由于FTP协议的特殊性，在进行FTP传输的时候，由于FTP 特有的Port模式和Passive模式，在进行数据传输的时候，需要动态的打开高端口，所以在使用TCP/IP过滤的情况下，经常会出现连接上后无法列出目录和数据传输的问题。所以在2003系统上增加的windows连接防火墙能很好的解决这个问题，所以都不推荐使用网卡的TCP/IP过滤功能。
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防火墙这点设置要注意 如果你更改了3389端口 一定要把新的端口加上 你就不能远程 该悲剧了
关于ftp安全 我建议大家使用win2003自带的ftp 设置好权限 这个用起来方便安全
IIS的安全：
删掉c:/inetpub目录，删除iis不必要的映射
为每个网站建立一个用户 把此用户加入游客组 iis匿名验证用户里面 加入此用户 网站目录权限 添加该用户 只给读取权限
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在”应用程序配置”里，我们给必要的几种脚本执行权限：ASP.ASPX,PHP，
ASP，ASPX默认都提供映射支持了的，对于PHP，需要新添加响应的映射脚本，然后在web服务扩展将ASP，ASPX都设置为允许，对于php以及CGI的支持，需要新建web服务扩展，在扩展名(X)：下输入 php ，再在要求的文件(E)：里添加地址 C:/php/sapi/php4isapi.dll ，并勾选设置状态为允许(S)。然后点击确定，这样IIS就支持PHP了。支持CGI同样也是如此。
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要支持ASPX，还需要给web根目录给上users用户的默认权限，才能使ASPX能执行。
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另外在应用程序配置里，设置调试为向客户端发送自定义的文本信息，这样能对于有ASP注入漏洞的站点，可以不反馈程序报错的信息，能够避免一定程度的攻击。
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在自定义HTTP错误选项里，有必要定义下譬如404,500等错误，不过有有时候为了调试程序，好知道程序出错在什么地方，建议只设置404就可以了。
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关闭不必要的组件服务
Computer Browser 维护网络上计算机的最新列表以及提供这个列表
Task scheduler 允许程序在指定时间运行
Messenger 传输客户端和服务器之间的 NET SEND 和 警报器服务消息
Distributed File System: 局域网管理共享文件，不需要禁用
Distributed linktracking client：用于局域网更新连接信息，不需要禁用
Error reporting service：禁止发送错误报告
Microsoft Serch：提供快速的单词搜索，不需要可禁用
NTLMSecuritysupportprovide：telnet服务和Microsoft Serch用的，不需要禁用
PrintSpooler：如果没有打印机可禁用
Remote Registry：禁止远程修改注册表
Remote Desktop Help Session Manager：禁止远程协助
Workstation关闭的话远程NET命令列不出用户组
关闭默认的空连接
通过组策略关闭 不必要的端口
差不多就是以上这些 设置好了 可以防范95%以上的黑客
有了有什么好的设置我会及时补充在这里